2016年12月18日，中国古生物学会古无脊椎动物学分会在贵州贵阳成立，共有来自中国科学院、高校、博物馆等20家单位的约80名古生物学领域的专家、学者和研究生等参加了成立大会。会上选举产生第一届理事会成员，并在随后召开的第一届理事会第一次会议上选举詹仁斌研究员（中国科学院南京地质古生物研究所）为理事长，何卫红教授（中国地质大学（武汉））、金小赤教授（中国地质科学院）、任东教授（首都师范大学）、孙元林教授（北京大学）为副理事长，蔡华伟研究员（中国科学院南京地质古生物研究所）为秘书长。

2017年12月8--10日，中国古生物学会古无脊椎动物学分会2017年度学术年会在中国科学院南京地质古生物研究所顺利召开。来自国内的科研机构、高等院校、地质古生物博物馆、出版机构、科普教育和化石保护等29家单位的专业工作者、专家学者和青年学生等150余名代表参加了会议。

2019年9月20日--23日，中国古生物学会古无脊椎动物学分会第二届学术年会在西北大学召开。本次大会由中国古生物学会古无脊椎动物学分会、陕西省科学技术协会主办，由西北大学地质学系、陕西省早期生命与环境重点实验室、陕西省古生物学会、大陆动力学国家重点实验室、西北大学博物馆和陕西紫阳野外科学观测研究基地承办。来自中国科学院南京地质古生物研究所、中国地质大学（北京、武汉）、南京大学、贵州大学、首都师范大学、中国科学院地质与地球物理研究所、中国地质科学院、云南大学、长安大学等21家科研单位的150余名学者和学生参加了此次会议。